Вирус тяжелого острого респираторного синдрома

Тяжелый острый респираторный синдром — ТОРС (Severe Acute Respiratory Syndrome, SARS) — термин, предложенный ВОЗ, вместо принятого ранее — «атипичная пневмония».
В конце 2002 г. — в ноябре-декабре — в западных провинциях Китая, в Гонконге, Вьетнаме, Сингапуре были отмечены первые случаи тяжелых острых респираторных заболеваний, привлекшие внимание врачей, обративших внимание на необычное течение данной воспалительной реакции дыхательных путей. Раньше в этой географической зоне были описаны вспышки микоплазменной пневмонии. Здесь высок процент заболеваний легких (бронхиальная астма, другие легочные болезни). В 97-99 гг. прошлого века были описаны спорадические случаи заболевания, которое в настоящее время трактуется как «тяжелый острый респираторный синдром». Тяжелый — так как у болезни плохой прогноз; острый — потому что начинается остро, как грипп; респираторный — потому что затронуты дыхательные пути; синдром, так как человек умирает не от пневмонии, а от отека легких. Удалось идентифицировать, что эти случаи вызваны коронавирусом.
Общая летальность составляет около 4%, с резкими колебаниями в разных возрастных группах.
Возбудитель SARS — один из представителей коронавирусов. Он был идентифицирован 17 марта 2003 г. По материалам ВОЗ было установлено, что возбудитель SARS представляет собой новый тип коронавируса.
Коронавирусы — крупные РНК, содержащие вирусы, способные вызывать заболевания у людей и животных. По антигенным свойствам разделяются на три группы. К первой принадлежат респираторный коронавирус человека 229Е, коронавирусы кошек, собак, свиней. Ко второй — человеческий вирус ОС43, вирус гепатита мышей и коронавирус телят. Третья группа включает в себя кишечные коронавирусы человека и вирусы инфекционного бронхита птиц.
Официально установлено, что SARS вызывает новый коронавирус, который ранее никогда не встречался у человека и животных. Новый вирус назвали SARS-ассоциированным коронавирусом. Изображение его получено с помощью электронной микроскопии.
Вирионы имеют сферическую форму диаметром 80–160 нм. Поверхность вириона покрыта булавовидными отростками, длиной около 20 нм, придающими вирионам форму короны.
Вирионы содержат плюс-цепь полиаденилированной РНК длиной 16–30 kb (коронавирусы обладают самым большим геномом, превосходящим геном других вирусов в три раза). Геномная нить (+) РНК коронавирусов, состоящая из одной цепочки, способна транслироваться на рибосомах клетки хозяина. Вирионы образуются почкованием от мембран шероховатого эндоплазматического ретикулума или аппарата Гольджи. Зрелые вирионы формируются внутри клеток до того, как вирусные белки будут экспрессированы на поверхности клеток. Вышедшие вирионы способны вновь сорбироваться на поверхности клеток, вызывая их слияние и стимулируя иммунный ответ хозяина. Основными клетками-мишенями являются клетки альвеолярного эпителия.
Вирус обнаружен в мокроте, плазме (в остром периоде); в фекалиях — в период реконвалесценции. Обладает относительно высокой устойчивостью в окружающей среде. Сохраняется на открытых поверхностях до трех часов. Быстро инактивируется дезинфицирующими средствами. Официально эпидемия SARS началась в феврале 2003 г. К апрелю 2003 г. очаги инфекции были зарегистрированы в 32 странах мира. Общее число заболевших составляет около 8,5 тыс. Причем 5 тыс. пациентов зарегистрировано в Китае. Хотя к концу мая 2003 г. официально эпидемия закончилась, но спорадические случаи по-прежнему регистрируются. Основной путь передачи воздушно-капельный, но не исключена и возможность передачи при прямом контакте. Восприимчивость невысокая, о чем свидетельствует небольшое число заболевших. Болезнь зарегистрирована только среди взрослых. Наибольшему риску заражения подвергаются лица пожилого возраста.
Коронавирусы обладают широким тропизмом и могут поражать помимо дыхательных путей печень, почки, кишечник, нервную систему, сердце и глаза. Типичная коронавирусная инфекция клинически проявляется гриппоподобным синдромом и/или кишечными расстройствами. При коронавирусной инфекции поражается альвеолярный эпителий. Коронавирусы, обладая способностью к индукции апоптоза, вызывают некроз пораженных тканей, а у пациентов после выздоровления остаются фиброзные рубцы в легких. Коронавирусы, индуцируя слияние клеток оказывают сильное воздействие на проницаемость клеток, что приводит к нарушению водно-солевого баланса и транспорта белков. Вероятно, в этих условиях развиваются недостаточность сурфактанта (антиателектатический фактор), что приводит к коллапсу альвеол, и легочный дистресс-синдром. Наиболее опасным свойством коронавирусов является их способность поражать макрофаги. Вероятнее всего, заболевание в особо тяжелой форме развивается на фоне блокирования основных звеньев иммунного ответа.
Клиническая картина
Инкубационный период от трех до пяти, максимум до 10 суток. Болезнь начинается остро, как грипп: высокая температура, головная боль, кашель, артралгии, миалгии. Начальная фаза может длиться от трех до семи суток. Заболевания средней тяжести и тяжелые формы связаны с развитием коронавирусной пневмонии. На фоне не очень тяжелых катаральных явлений процесс быстро поражает нижний отдел респираторного тракта и характеризуется развитием долевой, многоочаговой или сливной пневмонии. Клинически это проявляется резким ухудшением состояния больного. Температура снижается до субфебрильных цифр, потом резко повышается до 39-40°С, появляются упорный непродуктивный кашель, затруднение дыхания, нарастают симптомы дыхательной недостаточности, которая прогрессирует. В ряде случаев физикальные изменения не определяются, но могут выслушиваться мелкопузырчатые хрипы и определяться участки притупления перкуторного звука. В 80% случаев дальнейшее состояние больного улучшается и наступает выздоровление, а в 10—20% болезнь прогрессирует. Развивается острый респираторный дистресс-синдром. Отмечено, что для SARS не характерны реакция корней легких, увеличение медиастинальных лимфатических узлов, выпот в плевральную полость и распад легочной ткани. От SARS погиб один из вирусологов, представитель ВОЗ, итальянец Карло Урбани, умер профессор-патологоанатом из Китая, производивший вскрытие погибшего от SARS жителя Вьетнама. Раньше предполагали, что человек от человека этим заболеванием заразиться не может. Эта точка зрения не подтвердилась. Однако родственники, находившиеся рядом с больными, не заболевали. Значит, для заражения необходим очень тесный контакт с пациентом, особому риску в связи с этим подвергаются врачи, медицинские сестры, технический персонал, проводившие определенные манипуляции на дыхательных путях.
На основании одной лишь клинической картины SARS можно только заподозрить. Важно отметить, что в клинической картине отсутствуют сыпь, полиаденопатия, гепатолиенальный синдром, острый тонзиллит, поражение нервной ткани.
Общий анализ крови выявляет лимфопению, лейкопению, тромбоцитопению. Биохимический анализ крови показывает высокий уровень ЛДГ, АСТ. R-логически у большинства больных обнаруживаются множественные очаги просветления неправильной формы, склонные в дальнейшем к слиянию. Очаги в легочной ткани имеют место у всех пациентов. При клиническом ухудшении очаги поражения быстро увеличиваются. SARS рентгенологически может быть неотличим от других тяжелых форм пневмонии. Используется ПЦР-диагностика. ИФА может быть задействован только для ретроспективного анализа.
При исследовании биопсийного материала обнаруживалась картина интерстициального воспаления с разрушением альвеолярных пневмоцистов. Постмортальные гистологические изменения соответствовали патоморфологической картине респираторного дистресс-синдрома.
При исследовании печени — мелкодисперсная жировая инфильтрация, точечный некроз гепатоцитов, селезенки — обширные поля ишемического некроза.
Врачам и медицинскому персоналу рекомендуется соблюдать правила санитарно-эпидемического режима, работать в перчатках, маске, съемном халате, защитных очках.
Среди мер защиты особое место принадлежит выявлению не только больных, но и контактировавших с ними лиц, людей, прибывших из регионов, признанных очагами этой инфекции, с последующей изоляцией до 10 суток под медицинским наблюдением.
Скрининг за предполагаемыми случаями тяжелого острого респираторного синдрома для выбывающих из областей, представляющих эпидемиологическую опасность
Рекомендациями ВОЗ установлена система взаимодействия с операторами аэропортов и другим персоналом: пассажиры, депортируемые по интернациональным линиям из опасных областей, опрашиваются (предпочтительно работниками здравоохранения) в пункте отправления до прохождения контроля. В ходе опроса следует установить:
- имеются ли у пассажира в настоящее время или отмечались ли по крайней мере в течение последних 48 ч какие-либо симптомы атипичной пневмонии;
- имел ли место контакт с больным, у которого подозревают атипичную пневмонию;
- отмечались ли у них лихорадка или симптомы лихорадки (если они не измеряли температуру).
Лица, в отношении которых имеется подозрение на атипичную пневмонию, должны быть направлены в инфекционную больницу. Люди, у которых отмечается только лихорадка, должны быть отделены от остальных пассажиров, после чего за ними устанавливается медицинское наблюдение.
Если у пассажира, следующего из эпидемиологически неблагополучной зоны, выявляется заболевание, сопровождающееся респираторными синдромами и лихорадкой, рекомендуется:
- по возможности, изолировать его от остальных пассажиров;
- обеспечить его защитной маской;
- все мероприятия следует проводить по схеме, принятой в случае атипичной пневмонии;
- для больного пассажира должен быть выделен отдельный туалет;
- командир самолета должен по радио информировать аэропорт назначения и медицинских работников о том, что прибывает пассажир, у которого подозревается SARS;
- по прибытии больной пассажир должен быть изолирован в аэропорту и направлен в медицинское учреждение.
Рекомендации для пассажиров, находившихся в непосредственном контакте с больным
Если медицинские службы устанавливают, что больной пассажир имеет подозрительные симптомы, все остальные пассажиры направляются в местные медицинские службы для последующего наблюдения.
Если у пассажира имеются симптомы, указывающие на возможность наличия SARS, необходимо выполнить следующие действия.
- Все, контактировавшие с больным, должны быть занесены в отдельный список, в котором указываются:
- пассажиры, сидящие в том же ряду или по меньшей мере в двух рядах впереди или сзади от больного пассажира;
- все, находившиеся на борту самолета;
- любой человек, имевший тесный контакт с больным, обеспечивший уход;
- каждый член экипажа самолета, на борту которого находился больной пассажир.
- Контактировавшие лица должны быть направлены в медицинские учреждения, необходимо указать их фамилии, адреса, детали, касающиеся контакта с больным; за этими пассажирами следует установить наблюдение сроком на 14 дней.
- Контактировавшие с больным лица должны немедленно обращаться к врачу при появлении каких-либо симптомов после прилета в течение 10 дней. Они также должны информировать свое окружение о том, что были в контакте с человеком, предположительно заболевшим SARS.
- Лица, находившиеся в контакте с предполагаемым больным, могут продолжать полет, если у них нет симптомов SARS.
- Если вероятный случай SARS находится под наблюдением одного медицинского пункта, то оттуда должна поступить информация в ближайшие медицинские учреждения, куда могут обратиться контактировавшие с больным лица. В течение 10 дней после контакта за ними ведется наблюдение, ежедневно измеряется температура.
Методы лечения SARS
Способов высокоэффективного лечения SARS в настоящее время не существует. Лица с симптомами SARS подлежат лечению в стационаре под постоянным контролем врача и полной изоляции от других пациентов. Из-за тяжести заболевания лечение следует начинать как можно скорее, по симптоматическим показателям, до подтверждения диагноза (см. таблицу 1).
Противовирусные препараты (рибавирин орально или внутривенно). Рибавирин — это пуриновый нуклеозид с широким спектром действия и антивирусной активностью, имеет сходство с гуанозином. Доказана активность этого препарата в отношении большого числа РНК-содержащих вирусов. Из-за относительно высокой токсичности рибавирина его применения следует избегать у лиц с дефектами иммунной системы (новорожденные, люди старше 65 лет, реципиенты органов и костного мозга, ВИЧ-положительные больные), а также у пациентов, проходящих курс терапии с использованием других препаратов — нуклеозидных аналогов (ацикловир, ганцикловир и т. д.).
Антибактериальные препараты. Антибиотики не действуют на коронавирус — этиологический агент SARS, но предотвращают присоединение вторичной бактериальной флоры, а также могут воздействовать на бактерии, вызывающие нетипичные пневмонии невирусного происхождения, эти средства могут использоваться до постановки окончательного диагноза.
Индукторы интерферона, в частности циклоферон, рекомендуются для профилактики и лечения SARS.
Стероидные гормоны орально или внутривенно применяют для снятия воспалительных симптомов и предупреждения отека легкого.
Может назначаться также легочный сурфактант BL.
Комбинированная терапия рибавирином и глюкокортикостероидами основана на положительном клиническом эффекте от их применения. Наилучший результат получен врачами госпиталя в Гонконге при назначении пациентам больших доз комбинированной терапии рибавирином и глюкокортикостероидами.
Наиболее эффективной признана следующая схема лечения больных с подтвержденным и предполагаемым диагнозом тяжелого острого респираторного синдрома.
Антибактериальная терапия
- Левофлоксацин 500 мг один раз в день в/в или внутрь.
- Или кларитромицин 500 мг два раза в день внутрь + амоксициллин/клавунат 375 мг три раза в день внутрь (детям, беременным, при подозрении на туберкулез).
Комбинации рибавирина и метилпреднизолона назначаются при наличии следующих условий.
- Тотальное или двустороннее поражение легких на рентгенограмме и постоянно высокая температура в течение двух дней.
- Клинические, рентгенологические или лабораторные данные, свидетельствующие об ухудшении состояния.
- Или насыщение крови кислородом менее 95%.
Пульс-терапия метилпреднизолоном
Условие — наличие двух признаков из нижеперечисленных:
- прогрессивное ухудшение клинических симптомов;
- прогрессивное ухудшение рентгенологических данных;
- снижение насыщения крови кислородом;
- длительная лимфопения.
Необходимой терапевтической процедурой при SARS является применение бронходилататоров с помощью небулайзера (альбутерол 0,5 мг через небулайзер совместно с кислородом в объеме 6 л в минуту, четыре раза в день, на протяжении семи дней). В качестве диагностических и лечебных процедур в этом случае рассматриваются также бронхоскопия, эндотрахеальная интубация для проведения искусственной вентиляции легких в случае гипоксемии без признаков левожелудочковой недостаточности.
Вакцины для профилактики коронавирусной инфекции
Несмотря на распространенность коронавирусов, разработка вакцин против инфекций, вызываемых ими, фактически не проводилась. Ни одна из стран не обладает даже ограниченным опытом конструирования и лабораторных испытаний коронавирусных вакцин.
Стратегия создания коронавирусных вакцин должна базироваться на следующих положениях.
Разработка инактивированной вакцины на основе коронавируса SARS или близких к нему изолятов.
Получение субъединичной вакцины с использованием поверхностных антигенов коронавирусов SARS.
Получение рекомбинантов с ослабленной вирулентностью путем генно-инженерного конструирования плазмидных ДНК-вакцин.
В настоящее время в НИИ гриппа РАМН подготовлены базы данных и материалы для конструирования ДНК-вакцины против коронавирусной инфекции, вызванной SARS.
Литература
- Вестник “ЗОЖ” – №9 май 2003.
- Киселев О. И., Деева Э. Г., Слита А. В., Платонов В. Г. Антивирусные препараты для лечения гриппа и ОРЗ. Дизайн препаратов на основе полимерных носителей. – СПб.: Центр “Время”, 2000.
- Информационный Экспресс-Бюллетень. Коронавирус SARS-возбудитель атипичной пневмонии (временные методические рекомендации). – СПб-Москва, 2003.
- Грипп и другие респираторные вирусные инфекции: эпидемиология, профилактика, диагностика и терапия//Под редакцией О. И. Киселева, И. Г. Маринича, А. А. Сомининой). – СПб.: “Боргес”, 2003.
- Canadian Health Network Report (http//mediresourse simpatico.ca/ features_detail.asp.news_id )
- Report on SARS (https://www.Cdc.Gov/ncidod/sars/fag.htm).
Н. В. Астафьева, кандидат медицинских наук, доцент
Е. Г. Белова, кандидат медицинских наук
МГМСУ, Москва
Источник
/
/
/
№8 19.05.2003
19 2003
.
.. , .. , .. , .. , .. ,
.. , .. .
.
” ” () Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) , , 2002 . 28 . 17 2003 7761 , 623 . 32 , , , .
.1 SARS 1 22 2003 [2]
17 2003 ” ” ” “. 13 9 . , . . 16 2003 , ” ” , SARS , [3]. , , . 90 % (SARS) SARS- , . , , , 200 , , [4]. , SARS- 20 % 250 (SARS), , , , (SARS) (.. ) [5]. , , . , , , , : , , . , , , .
.
. , , – , . ( 2). , [6].
.
1 | Human coronavirus 229E (HcoV-229E) Porcine Transmissible gastroenteritis virus (TGEV) Porcine respiratory coronavirus (PRCoV) Canine Coronavirus (CcoV) Feline enteric coronavirus (FECoV) Feline infectious peritonitis virus (FIPV) Rabbit coronavirus (RbCoV) | |
2 | Human coronavirus OC43 (HcoV- OC43) Murine hepatitis virus (MHV) Sialodacryoadenitis virus (SDAV) Porcine hemagglutinating encephalomyelitis (HEV) Bovine coronavirus (BcoV) Turkey coronavirus (TcoV) | |
3 | Avian infectious bronchitis virus (IBV) Turkey coronavirus (TcoV) |
, . – HcoV-229E; MHV; BcoV; IBV 27000 32000 [7].
, (SARS), (CDC) “Vanderbild University Medical Center”. (SARS) 29727 .. 29736 .. [8, 9].
SARS (Institute of Microbiology and Epidemiology of the Academy of Military Medical Sciences and the Beijing Genomics Institute of Chinese Academy of Sciences) [10]. , , , [11].
Bernard Nocht Institute of Tropical Medicine , (SARS) 50-60 % , , , 2 3 [12].
, , 2, 3.
2. , 405 1b ( 15173 15578 NC_003045), SARS .
(I, II III), 229E (HcoV-229E), (CcoV), (FIPV), (TGEV), (TGEV), OC43 (HcoV-OC43), (BcoV), (HEV), (SDAV), (MHV), (TcoV) (IBV). ( 100 ), 50 % , . .[13]
3. (215 ) SARS [14].
C SARS , SARS 2- (. 4). (. 5-7). . SARS , SARS, , SARS . , . ( ) , .
(POL), (M) (VGL) ; , 20 %. ( 229E OC43)- : SARS OC43 ( ), 229E SARS, – . (// OC43), (/// 229E) () SARS. SARS , 6 , , , . .
.4 , SARS () . , “” , , , . (SARS) .
1. | bov-ent | 52 | Bovine coronavirus (isolate BCoV-ENT) |
2. | mhv-2 | 46 | Murine hepatitis virus (strain 2) |
3. | mhv-ml1 | 46 | Murine hepatitis virus (strain ML-11) |
4. | mhv-ml0 | 46 | Murine hepatitis virus (strain ML-10) |
5. | mhv-a59 | 45 | Murine coronavirus MHV (strain A59) |
6. | mhv-pen | 44 | Murine hepatitis virus (strain Penn 97-1) |
7. | por-pur | 44 | Porcine transmissible gastroenteritis (strain Purdue) |
8. | por-cv | 41 | Porcine epidemic diarrhea virus (strain CV777) |
9. | hum-229 | 40 | Human coronavirus (strain 229E) |
10. | avi-bea | 33 | Avian infectious bronchitis virus (strain Beaudette) |
. 4. SARS c
(%): | |||
POL | gene | % | |
1. | sars | 100.00 | |
2. | bov-ent | 60.87 | Bovine coronavirus /isolate=”BCoV-ENT” |
3. | mhv-a59 | 60.58 | Murine coronavirus MHV (strain A59) |
4. | mhv-2 | 60.47 | Murine hepatitis virus (strain 2) |
5. | mhv-ml1 | 60.47 | Murine hepatitis virus (strain ML-11) |
6. | mhv-ml0 | 60.40 | Murine hepatitis virus (strain ML-10) |
7. | mhv-pen | 60.25 | Murine hepatitis virus (strain Penn 97-1) |
8. | mhv-jhm | 59.85 | Murine coronavirus MHV (strain JHM) |
9. | por-cv | 55.12 | Porcine epidemic diarrhea virus /strain=”CV777″ |
10. | por-pur | 54.51 | Porcine transmissible gastroenteritis (Purdue) |
11. | hum-229 | 54.47 | Human coronavirus (strain 229E) |
12. | avi-bea | 53.75 | Avian infectious bronchitis virus /Beaudette |
: 67.95 % |
. 5. POL SARS c
(%): | |||
M | gene | % | |
1. | bov-ent | 39.57 | Bovine coronavirus /isolate=”BCoV-ENT” |
2. | VME1_CVBM | 39.13 | Bovine coronavirus (strain Mebus) |
3. | VME1_CVTKE | 38.70 | Turkey enteric coronavirus (TCV) |
4. | VME1_CVHOC | 38.70 | Human coronavirus (strain OC43) |
5. | VME1_CVMA5 | 37.12 | Murine coronavirus MHV (strain A59) |
6. | mhv-2 | 37.12 | Murine hepatitis virus (strain 2) |
7. | VME1_CVMJH | 36.68 | Murine coronavirus MHV (strain JHM) |
8. | por-cv | 30.84 | Porcine epidemic diarrhea virus /strain=”CV777″ |
9. | VME1_CVH22 | 27.31 | Human coronavirus (strain 229E) |
10. | VME1_IBVK | 26.87 | Avian infectious bronchitis virus (strain KB8523) |
11. | VME1_IBV6 | 26.43 | Avian infectious bronchitis virus (strain 6/82) |
12. | VME1_IBVB | 25.99 | Avian infectious bronchitis virus (strain Beaudette) |
13. | VME1_IBVB2 | 25.99 | Avian infectious bronchitis virus (Beaudette M42) |
14. | VME1_CVPRM | 24.81 | Porcine respiratory coronavirus (strain RM4) |
15. | VGL1_CVPR8 | 24.43 | Porcine respiratory coronavirus (strain 86/137004) |
16. | VME1_CVPFS | 24.43 | Porcine transmissible gastroenteritis (FS772/70) |
17. | VME1_CVPPU | 24.43 | Porcine transmissible gastroenteritis (strain Purdue) |
18. | VME1_FIPV | 24.05 | Feline infectious peritonitis virus (strain 79-1146) |
19. | VME1_CVCAI | 23.28 | Canine enteric coronavirus (strain Insavc-1) |
: 42.76 % |
. 6. M SARS c
(%): | |||
VGL | gene | % | |
1. | VGL2_CVMJH | 23.82 | Murine coronavirus MHV (strain JHM) |
2. | VGL2_CVHOC | 23.19 | Human coronavirus (strain OC43) |
3. | VGL2_CVBLY | 23.13 | Bovine coronavirus (strain LY-138) |
4. | VGL2_CVBV | 23.06 | Bovine coronavirus (strain vaccine) |
5. | VGL2_CVBL9 | 22.99 | Bovine coronavirus (strain L9) |
6. | VGL2_CVBM | 22.92 | Bovine coronavirus (strain Mebus) |
7. | VGL2_CVBQ | 22.84 | Bovine coronavirus (strain Quebec) |
8. | VGL2_CVM4 | 22.81 | Murine coronavirus MHV (strain wild type 4) |
9. | VGL2_CVMJC | 22.81 | Murine coronavirus MHV (strain JHMV/variant CL-2) |
10. | VGL2_CVMA5 | 22.75 | Murine coronavirus MHV (strain A59) |
11. | VGL2_IBVK | 17.40 | Avian infectious bronchitis virus (strain KB8523) |
12. | VGL2_IBVM | 16.93 | Avian infectious bronchitis virus (strain M41) |
13. | VGL2_IBVB | 16.77 | Avian infectious bronchitis virus (strain Beaudette) |
14. | VGL2_CVH22 | 16.26 | Human coronavirus (strain 229E) |
15. | VGL2_CVPRM | 15.78 | Porcine respiratory coronavirus (strain RM4) |
16. | VGL2_CVPR8 | 15.70 | Porcine respiratory coronavirus (strain 86/137004) |
17. | VGL2_CVCAI | 14.93 | Canine enteric coronavirus (strain Insavc-1) |
18. | VGL2_CVPMI | 14.63 | Porcine transmissible gastroenteritis (strain Miller) |
19. | VGL2_FIPV | 14.60 | Feline infectious peritonitis virus (strain 79-1146) |
20. | VGL2_CVPFS | 14.56 | Porcine transmissible gastroenteritis (strain FS772/70) |
21. | VGL2_CVPPU | 14.42 | Porcine transmissible gastroenteritis (strain Purdue) |
22. | VGL2_CVPPR | 14.35 | Porcine transmissible gastroenteritis (Pur46-MAD) |
23. | VGL2_CVPRT | 14.29 | Porcine transmissible gastroenteritis (strain NEB72-rt) |
. 7. VGL SARS c .
SARS, ” ” 13 : ; ; , .
, 50 % , , , , [5].
” “.
” ” , . , DC Health Canada (SARS) 2003 [15].
26 , 80 13 ” ” [16].
, (SARS) .
” ” – 25-70 . 15 .
2-7 ; 10 .
. > 38° , , , . , – , .
3-7 , , , . . , 80-90 % , 6-7 . , ” ” . , , , . 3-4 , .
( ), . , .
, .
– 40 [17].
(SARS), , CDC .
” ” :
38°
(, , )
10 SARS .
“” :
, [18].
” “. , . DC . – ß-, , , .
, , . , , (SARS) [19].
(SARS) , . , , . , , , [17]. , CDC (, / ), [20].
, , .
, (SARS) .
SARS , . () 20 , [21]. , .
SARS.
, (SARS), . , .
, . , , , , , (SARS) , , – , SARS, . (SARS), [22] , (, , , , , , , ) SARS.
, . , (SARS) , SARS . .
SARS , SARS . (SARS) :
– SARS ; (, , ) .
– (“false-negative”). .
– , ( RT-PCR ). , .
– , ( ELISA ).
(SARS) (SARS) , . , (SARS) . web- CDC () [23].
, , , , (SARS). (SARS).
1. .
ELISA IFA. ELISA (SARS) , 21- . , , , . . SARS , BSL-3 , 2-4 .
2. (PCR).
— SARS- (, , ) . , , PCR-, web . – , , SARS- . , [23].
7 – , , (SARS), . . . – Bernard Nocht Institute of Tropical Medicine ().
PCR, , . .
(SARS) , PCR-.
1. Bernhard-Nocht Institute (Bernhard-Nocht Str. 74 D-20359 Hamburg, Germany).
BNIoutS/BNoutAs: sense ATGAAT TAC CAA GTC AAT GGT TAC
antisense CAT AAC CAG TCG GTA CAG CTA C
FraGment lenGth 195 bp
BNIinS/BNIAs: sense GAA GCT ATT CGT CAC GTT CG
antisense CTGTAGAAA ATC CTA GCT GGA G
Fragment length 110 bp
SAR1s/SAR1as: sense CCT CTC TTG TTC TTG CTC GCA
antisense TAT AGT GAG CCG CCA CAC ATG
Fragment length 150 bp
Amplicon sequence (BNI-1, Bernhard-Nocht Institute, Hamburg, Germany)
TACCGTAGACTCATCTCTATGATGGGTTTCAAAATGAATTACCA
AGTCAATGGTTACCCTAATATGTTTATCACCCGCGAAGAAGCTAT
TCGTCACGTTCGTGCGTGGATTGGCTTTGATGTAGAGGGCTGTCAT
GCAACTAGAGATGCTGTGGGTACTAACCTACCTCTCCAGCTAGGA
TTTTCTACAGGTGTTAACTTAGTAGCTGTACCGACTGGTTATGTTGA
CACTGAAAATAACACAGAATTCACCAGAGTTAATGCAAAACCTCC
ACCAGGTGACCAGTTTAAACATCTTATACC
2. Centers for Disease Control & Prevention (National Centers for Infectious Diseases,
Atlanta GA 30333 1600 Clifton Road, NE, MS-C12 United States)
SARS-specific primers:
Cor-p-F2 (+) 5’CTAACATGCTTAGGATAATGG 3′,
Cor-p-F3 (+) 5’GCCTCTCTTGTTCTTGCTCGC 3′,
Cor-p-R1 (-) 5’CAGGTAAGCGTAAAACTCATC 3′,
Product size:
Cor-p-F2/Cor-p-R1 :368 bp
Cor-p-F3/Cor-p-R1 :348 bp
3. Government Virus Unit 9/F Public Health Laboratory Centre (382 NAm Cheong Street Shek Kip Mei Kowloon, Hong Kong SAR Hong Kong – SAR China)
COR-1,COR-2: sense 5′ CAC CGT TTC TAC AGG TTA GCT AAC GA 3′
antisense 5′ AAA TGT TTA CGC AGG TAA GCG TAA AA 3′
Product size: 310 bp
4. Queen Mary Hospital (The University of Hong Kong University Pathology Building Hong Kong – SAR China)
HKU: sense 5′ TACACACCTCAGCGTTG 3′
antisense 5′ CACGAACGTGACGAAT 3′
Product size 182 bps [23]
, (SARS) PCR-, , , , .
3. .
(SARS) ( , ) . SARS . , [24,25].
Reuters [26] “Artus GmbH” – (SARS). , . “Artus GmbH” “Bernhard-Nocht Institute for Tropical Medicine” – , (SARS). , , , , . , , , .
“Artus GmbH” – , SARS, , , , [26]
, , (SARS) [11]. , . SARS- 29000 . — 200-500 . , . .
, , . , . – SARS , , . -, , . – , 500-1000 . . . , , 10000 . , , , , , , , , , [27].
Beijing Genomics SARS , , [28]. , , , SARS . , , -, , , . , , , . SARS- , – [29].
, , c SARS- . , , , -. , (SARS), .
“” .., .., .. , .
1. Cumulative Number of Reported Probable Cases of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). 2003. . https://www.who.int/csr/sarscountry/2003_04_26/en/
2. Epidemic curves – Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). 2003.
. https://www.who.int/csr/sarsepicurve/epiindex/en/index1.html
3. Coronavirus never before seen in humans is the cause SARS. 2003
. https://www.who.int/mediacentre/releases/2003/pr31/en/print.html
4. PRO/EDR> SARS – worldwide (64): etiology 20030423.0996. C ProMED-mail’s International Society for Infectious Diseases.https://www.promedmail.org/pls/askus/f?p=2400:1202:98395027374564076::NO::F2400_P1202_CHECK_DISPLAY,F2400_P1202_PUB_MAIL_ID:X,21204
5. PRO/EDR> SARS – worldwide (67): cases 20030424.1007. C ProMED-mail’s International Society for Infectious Diseases.https://www.promedmail.org/pls/askus/f?p=2400:1202:98395027374564076::NO::F2400_P1202_CHECK_DISPLAY,F2400_P1202_PUB_MAIL_ID:X,21386
6. Lai M.M.C., Holmes K.V. Coronaviridae: The viruses and their replication. Fields virology. vol.1. [ed. D. M. Knipe, P.M. Howley, D.E. Griffin.- 4th ed,] 2001. Lip.Wil.&Wilkins. USA. p.1163.
7. Enterz. NC_002645; NC_001846; NC_003045; NC_001451.
8. Bellini W.J., Campagnoli R.P., Icenogle J.P., et al. SARS coronavirus (SARS-CoV), Urbani strain. Unpublished. 2003. https://www.cdc.gov/ncidod/sars/pdf/nucleoseq.pdf
9. SARS coronavirus, complete genome. Entrez . NC_004718
10. Qin,E., Zhu,Q., Yu,M., et al., 2003. GenBank. AY278487; AY278488 ; AY278489 ; AY278490; AY279354 . https://www.genomics.org.cn:8080/bgi/news/zhongxin/news030416-2_popmsg.htm
11. Two SARS-associated viral genomes were sequenced in Beijing. 2003. https://www.genomics.org.cn:8080/bgi/news/zhongxin/news030416-2.htm;
12. Drosten C., Gunther S., Preiser W., et al.. Identification of a Novel Coronavirus in Patients with Severe Acute Respiratory Syndrome. //N. Engl. J. Med. 2003. www.nejm.org https://content.nejm.org/cgi/reprint/NEJMoa030747v2.pdf
13. Ksiazek TG, Erdman D, Goldsmith CS et al. A Novel Coronavirus Associated with Severe Acute Respiratory Syndrome. // N. Engl. J. Med. 2003. www.nejm.org https://content.nejm.org/cgi/reprint/NEJMoa030781v3.pdf
14. Peiris J S M, Lai S T, Poon L L M, et al. Coronavirus as a possible cause of severe acute respiratory syndrome. // THE LANCET Published online. 2003. https://image.thelancet.com/extras/03art3477web.pdf
15. Preliminary Clinical Description of Severe Acute Respiratory Syndrome.// MMWR Weekly. 2003. V.52. N12. P. 255-256. https://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/mm5212a5.htm
16. Clinical hold virtual conference on management of SARS patients. . 2003. www.who.int/csr/clinicansconference/en.print.html
17. Hsu L-Y, Lee C-C, Green JA, et al. Severe acute respiratory syndrome (SARS) in Singapore: clinical features of index patient and initial contacts. // Emerg. Infect. Dis. [serial online] 2003. https://www.cdc.gov/ncidod/EID/vol9no6/03-0264.htm)
18. Updated Interim U.S. Case Definition of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). 2003. https://www.cdc.gov/ncidod/sars/casedefinition.htm
19. Atrasheuskaya A.V., Fredeking T.M., Ignatyev G.M. Changes in immune parameters and their correction in human cases of tick-borne encephalitis. // Clin. Exp. Immunol. 2003. V.131.
P. 148-154.
20. Outbreak of Severe Acute Respiratory Syndrome —Worldwide, 2003. MMWR Weekly// 2003. V.52. N11. P. 226-228. https://www.cdc.gov/mmwr/preview/mmwrhtml/mm5211a5.htm
21. HK Doctors Use Antibodies to Treat Pneumonia Victims. 2003. https://www.reuters.com/newsArticle.jhtml?type=scienceNews&storyID=2477221
22. Case Definitions for Surveillance of Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS). . 2003. https://www.who.int/csr/sars/casedefinition/en/
23. PCR primers for SARS developed by WHO Network Laboratories. 2003. . https://www.who.int/csr/sars/primers/en/
24. Heymann D. L. Status of the global SARS outbreak and lessons for the immediate future. 2003. . https://www.who.int/csr/sarsarchive/2003_04_11/en/tests
25. SARS: Availability and use of laboratory testing. 2003. . https://www.who.int/csr/sars/testing2003_04_18/en/
26. Blenkinsop P. German Firm Distributes First Sars Test Worldwide. 2003. https://www.nlm.nih.gov/medlineplus/news/fullstory_12350.html
27. Testing for the SARS virus: hopes and realities //Strait Times Interactive. 2003.
https://straitstimes.asis1.com.sg
28. Progress in genome sequencing of Chinese isolates of SARS virus. 2003.
https:// www.gpbjournal.org/sars.jsp
29. Shared mutations in the genomes of SARS coronaviruses. 2003.
https://www.biomedcentral.com/news/20030416/04
5266
Источник